Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sfr1Q8BP27 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfr1Q8BP27 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfr1Q8BP27 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sfr1Q8BP27 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sfr1Q8BP27 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfr1Q8BP27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfr1Q8BP27 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms