Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup93Q8BJ71 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup93Q8BJ71 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup93Q8BJ71 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup93Q8BJ71 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup93Q8BJ71 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms