Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms