Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm9sf4Q8BH24 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm9sf4Q8BH24 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tm9sf4Q8BH24 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tm9sf4Q8BH24 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm9sf4Q8BH24 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms