Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best2Q8BGM5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best2Q8BGM5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best2Q8BGM5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best2Q8BGM5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best2Q8BGM5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Best2Q8BGM5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best2Q8BGM5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best2Q8BGM5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best2Q8BGM5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best2Q8BGM5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Best2Q8BGM5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms