Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm3Q80WV7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm3Q80WV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srrm3Q80WV7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srrm3Q80WV7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srrm3Q80WV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srrm3Q80WV7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.5 ms