Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf5Q7TSN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf5Q7TSN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igsf5Q7TSN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igsf5Q7TSN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf5Q7TSN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf5Q7TSN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf5Q7TSN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf5Q7TSN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Igsf5Q7TSN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Igsf5Q7TSN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Igsf5Q7TSN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms