Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf516Q7TSH3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf516Q7TSH3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf516Q7TSH3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf516Q7TSH3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf516Q7TSH3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms