Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg4Q7TMD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg4Q7TMD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg4Q7TMD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg4Q7TMD7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg4Q7TMD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg4Q7TMD7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms