Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MylkQ6PDN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MylkQ6PDN3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MylkQ6PDN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MylkQ6PDN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MylkQ6PDN3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MylkQ6PDN3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms