Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smchd1Q6P5D8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smchd1Q6P5D8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smchd1Q6P5D8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smchd1Q6P5D8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smchd1Q6P5D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smchd1Q6P5D8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smchd1Q6P5D8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.9 ms