Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bfsp2Q6NVD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bfsp2Q6NVD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bfsp2Q6NVD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bfsp2Q6NVD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bfsp2Q6NVD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bfsp2Q6NVD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bfsp2Q6NVD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bfsp2Q6NVD9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bfsp2Q6NVD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bfsp2Q6NVD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bfsp2Q6NVD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms