Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms