Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdc5lQ6A068 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdc5lQ6A068 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdc5lQ6A068 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdc5lQ6A068 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdc5lQ6A068 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdc5lQ6A068 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc5lQ6A068 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc5lQ6A068 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc5lQ6A068 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms