Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
PtprdQ64487 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,14■■□□□ 1,61
PtprdQ64487 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
PtprdQ64487 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
PtprdQ64487 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
PtprdQ64487 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
PtprdQ64487 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
PtprdQ64487 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,07■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
PtprdQ64487 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,98■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
PtprdQ64487 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24,91■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
PtprdQ64487 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
PtprdQ64487 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,8■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
PtprdQ64487 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,71■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24,71■■□□□ 1,55
PtprdQ64487 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
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