Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprdQ64487 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprdQ64487 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprdQ64487 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprdQ64487 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprdQ64487 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprdQ64487 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprdQ64487 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprdQ64487 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprdQ64487 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprdQ64487 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprdQ64487 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprdQ64487 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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