Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr2e1Q64104 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e1Q64104 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e1Q64104 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e1Q64104 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr2e1Q64104 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr2e1Q64104 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms