Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1aQ62266 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr1aQ62266 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1aQ62266 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr1aQ62266 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr1aQ62266 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1aQ62266 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms