Protein–RNA interactions for Protein: Q61292

Lamb2, Laminin subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb2Q61292 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Lamb2Q61292 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Lamb2Q61292 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Lamb2Q61292 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Lamb2Q61292 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Lamb2Q61292 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Lamb2Q61292 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Lamb2Q61292 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lamb2Q61292 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Lamb2Q61292 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Lamb2Q61292 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Lamb2Q61292 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Lamb2Q61292 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Lamb2Q61292 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Lamb2Q61292 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms