Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stxbp3Q60770 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stxbp3Q60770 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stxbp3Q60770 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stxbp3Q60770 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stxbp3Q60770 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stxbp3Q60770 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stxbp3Q60770 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms