Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mkrn3Q60764 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mkrn3Q60764 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mkrn3Q60764 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mkrn3Q60764 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mkrn3Q60764 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mkrn3Q60764 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mkrn3Q60764 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms