Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms