Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgap44Q5SSM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap44Q5SSM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap44Q5SSM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap44Q5SSM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap44Q5SSM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap44Q5SSM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap44Q5SSM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms