Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rtp3Q5QGU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Rtp3Q5QGU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rtp3Q5QGU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,95
Rtp3Q5QGU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Rtp3Q5QGU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rtp3Q5QGU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Rtp3Q5QGU6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6,7 ms