Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1d1Q3UV55 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1d1Q3UV55 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1d1Q3UV55 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1d1Q3UV55 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1d1Q3UV55 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms