Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zscan4fQ3URS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zscan4fQ3URS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zscan4fQ3URS2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4fQ3URS2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zscan4fQ3URS2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zscan4fQ3URS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zscan4fQ3URS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zscan4fQ3URS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zscan4fQ3URS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zscan4fQ3URS2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4fQ3URS2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms