Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbrQ3U9G9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LbrQ3U9G9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LbrQ3U9G9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LbrQ3U9G9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LbrQ3U9G9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LbrQ3U9G9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LbrQ3U9G9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LbrQ3U9G9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LbrQ3U9G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbrQ3U9G9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbrQ3U9G9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbrQ3U9G9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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