Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc9Q3U0M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc9Q3U0M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc9Q3U0M1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc9Q3U0M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc9Q3U0M1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc9Q3U0M1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc9Q3U0M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc9Q3U0M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc9Q3U0M1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc9Q3U0M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc9Q3U0M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc9Q3U0M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms