Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp8Q2V6D6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp8Q2V6D6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbp8Q2V6D6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp8Q2V6D6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp8Q2V6D6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms