Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Traf3ip1Q149C2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Traf3ip1Q149C2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Traf3ip1Q149C2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Traf3ip1Q149C2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Traf3ip1Q149C2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Traf3ip1Q149C2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Traf3ip1Q149C2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Traf3ip1Q149C2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Traf3ip1Q149C2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Traf3ip1Q149C2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Traf3ip1Q149C2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Traf3ip1Q149C2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Traf3ip1Q149C2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Traf3ip1Q149C2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Traf3ip1Q149C2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Traf3ip1Q149C2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms