Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YPS3YLR121C 1527 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 LOT5YKL183W 921 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 GND1YHR183W 1470 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 DUS3YLR401C 2007 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 LSM5YER146W 282 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 FET5YFL041W 1869 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 FLR1YBR008C 1647 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 DUR3YHL016C 2208 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 ESS1YJR017C 513 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 GPN2YOR262W 1044 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 ALR1YOL130W 2580 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 YPL251WYPL251W 303 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 MET30YIL046W 1923 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 POP2YNR052C 1302 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 INH1YDL181W 258 nt9□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 NAP1YKR048C 1254 nt9□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 YAR028WYAR028W 705 nt9□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 DLD3YEL071W 1491 nt9□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 SAM2YDR502C 1155 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 ALP1YNL270C 1722 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 YNL190WYNL190W 615 nt8.98□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 ORT1YOR130C 879 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 RIM2YBR192W 1134 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 snR4snR4 186 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC39Q12745 DLD2YDL178W 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 RPC31YNL151C 756 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 MTG2YHR168W 1557 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 SFL1YOR140W 2301 nt8.94□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 LEU4YNL104C 1860 nt8.94□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 YLR046CYLR046C 813 nt8.93□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 ADE16YLR028C 1776 nt8.93□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 AKR2YOR034C 2250 nt8.92□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 NPP2YEL016C 1482 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 HEM13YDR044W 987 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 APT2YDR441C 546 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 AIM1YAL046C 357 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 DPL1YDR294C 1770 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 SEN2YLR105C 1134 nt8.9□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 YMR103CYMR103C 363 nt8.9□□□□□ -0.98
SEC39Q12745 HXT12YIL170W 1374 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 MAS1YLR163C 1389 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 SMM1YNR015W 1155 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 FCY21YER060W 1587 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 LAS17YOR181W 1902 nt8.88□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 HEM14YER014W 1620 nt8.88□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 TRP2YER090W 1524 nt8.88□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 VMA11YPL234C 495 nt8.86□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 PFS2YNL317W 1398 nt8.86□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 ITR2YOL103W 1830 nt8.85□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 TIP1YBR067C 633 nt8.85□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 HSV2YGR223C 1347 nt8.84□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 HXT11YOL156W 1704 nt8.84□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 PUP1YOR157C 786 nt8.84□□□□□ -0.99
SEC39Q12745 RIB2YOL066C 1776 nt8.84□□□□□ -1
SEC39Q12745 SEC61YLR378C 1443 nt8.82□□□□□ -1
SEC39Q12745 THI6YPL214C 1623 nt8.82□□□□□ -1
SEC39Q12745 KRR1YCL059C 951 nt8.81□□□□□ -1
SEC39Q12745 AIM34YMR003W 597 nt8.81□□□□□ -1
SEC39Q12745 PRY1YJL079C 900 nt8.8□□□□□ -1
SEC39Q12745 ENT4YLL038C 744 nt8.8□□□□□ -1
SEC39Q12745 FRA1YLL029W 2250 nt8.8□□□□□ -1
SEC39Q12745 VRG4YGL225W 1014 nt8.79□□□□□ -1
SEC39Q12745 STP3YLR375W 1032 nt8.79□□□□□ -1
SEC39Q12745 YBR232CYBR232C 360 nt8.79□□□□□ -1
SEC39Q12745 SRM1YGL097W 1449 nt8.79□□□□□ -1
SEC39Q12745 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.78□□□□□ -1
SEC39Q12745 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.78□□□□□ -1
SEC39Q12745 YDR467CYDR467C 327 nt8.78□□□□□ -1
SEC39Q12745 OXA1YER154W 1209 nt8.78□□□□□ -1
SEC39Q12745 SNX3YOR357C 489 nt8.78□□□□□ -1
SEC39Q12745 RSC4YKR008W 1878 nt8.77□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 PGC1YPL206C 966 nt8.77□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 PAU5YFL020C 369 nt8.76□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 MCM5YLR274W 2328 nt8.76□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 FTH1YBR207W 1398 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 NSG2YNL156C 900 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 CCT5YJR064W 1689 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 CHA1YCL064C 1083 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 YER188WYER188W 720 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 MDH2YOL126C 1134 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 FRT1YOR324C 1809 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 TAT2YOL020W 1779 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 GGC1YDL198C 903 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 EMC3YKL207W 762 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 OSH7YHR001W 1314 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC39Q12745 TAF13YML098W 504 nt8.71□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 SLM3YDL033C 1254 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 YJL064WYJL064W 396 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 PAU19YMR325W 375 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 ITR1YDR497C 1755 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 DIA4YHR011W 1341 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 PMA2YPL036W 2844 nt8.67□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 PRC1YMR297W 1599 nt8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms