Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 MEP3YPR138C 1470 nt10.09□□□□□ -0.79
SRF1Q12516 LIP1YMR298W 453 nt10.08□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 NEM1YHR004C 1341 nt10.07□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 EDC2YER035W 438 nt10.07□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 PCP1YGR101W 1041 nt10.07□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 DAK2YFL053W 1776 nt10.06□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 YHM2YMR241W 945 nt10.06□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 ATP6Q0085 780 nt10.05□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 FLX1YIL134W 936 nt10.04□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 YMR103CYMR103C 363 nt10.04□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 SWE1YJL187C 2460 nt10.03□□□□□ -0.8
SRF1Q12516 SAM3YPL274W 1764 nt10.02□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 SSN3YPL042C 1668 nt10.02□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 SER2YGR208W 930 nt10.01□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 TPS1YBR126C 1488 nt10□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 BSP1YPR171W 1731 nt10□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 PRE5YMR314W 705 nt10□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 YPL251WYPL251W 303 nt10□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 UME6YDR207C 2511 nt10□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 YPL247CYPL247C 1572 nt10□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 KAE1YKR038C 1161 nt9.98□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 BRR1YPR057W 1026 nt9.98□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 IRC24YIR036C 792 nt9.97□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 PHO23YNL097C 993 nt9.97□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 HTS1YPR033C 1641 nt9.96□□□□□ -0.81
SRF1Q12516 TOA2YKL058W 369 nt9.96□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 BNI5YNL166C 1347 nt9.96□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 LSM12YHR121W 564 nt9.95□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 OYE2YHR179W 1203 nt9.95□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 THP3YPR045C 1413 nt9.94□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 BAP3YDR046C 1815 nt9.93□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.93□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 CYC3YAL039C 810 nt9.93□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 MRP1YDR347W 966 nt9.92□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 NAS2YIL007C 663 nt9.92□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 CDD1YLR245C 429 nt9.91□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 RAS2YNL098C 969 nt9.91□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 YEL074WYEL074W 339 nt9.9□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 YJR154WYJR154W 1041 nt9.9□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 MSC1YML128C 1542 nt9.9□□□□□ -0.82
SRF1Q12516 STD1YOR047C 1335 nt9.89□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 FCY1YPR062W 477 nt9.89□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 MOB1YIL106W 945 nt9.88□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 LEU9YOR108W 1815 nt9.88□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 SPS100YHR139C 981 nt9.87□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 BET2YPR176C 978 nt9.87□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 YJL107CYJL107C 1164 nt9.86□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 SPE2YOL052C 1191 nt9.86□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 SAM2YDR502C 1155 nt9.85□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 RSC8YFR037C 1674 nt9.85□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.84□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.84□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.84□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.84□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.84□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 EMC3YKL207W 762 nt9.84□□□□□ -0.83
SRF1Q12516 YBL086CYBL086C 1401 nt9.83□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 ADH3YMR083W 1128 nt9.83□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 GND2YGR256W 1479 nt9.83□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 SEC61YLR378C 1443 nt9.82□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.82□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 EAF3YPR023C 1206 nt9.82□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 HXT1YHR094C 1713 nt9.81□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt9.8□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 TMA23YMR269W 636 nt9.8□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 PHO92YDR374C 921 nt9.79□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 PHB2YGR231C 933 nt9.79□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 MOD5YOR274W 1287 nt9.79□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 YPL041CYPL041C 624 nt9.79□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 YGR210CYGR210C 1236 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 YBL095WYBL095W 813 nt9.78□□□□□ -0.84
SRF1Q12516 URA6YKL024C 615 nt9.77□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 FSH2YMR222C 672 nt9.77□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 DBP1YPL119C 1854 nt9.76□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 OXA1YER154W 1209 nt9.76□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 YER188WYER188W 720 nt9.76□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 SPG1YGR236C 288 nt9.76□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 PRM5YIL117C 957 nt9.76□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 FTH1YBR207W 1398 nt9.75□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 YGL118CYGL118C 438 nt9.74□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 IMO32YGR031W 1029 nt9.74□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 RIM2YBR192W 1134 nt9.74□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 FUB1YCR076C 753 nt9.73□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 YLR036CYLR036C 612 nt9.73□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 AST1YBL069W 1290 nt9.73□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 COS10YNR075W 1125 nt9.73□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 GDH1YOR375C 1365 nt9.73□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 ZRT3YKL175W 1512 nt9.72□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 DDI1YER143W 1287 nt9.72□□□□□ -0.85
SRF1Q12516 LSM5YER146W 282 nt9.71□□□□□ -0.86
SRF1Q12516 RSM23YGL129C 1353 nt9.71□□□□□ -0.86
SRF1Q12516 YML079WYML079W 606 nt9.69□□□□□ -0.86
SRF1Q12516 YMR210WYMR210W 1350 nt9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.6 ms