Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP36Q12481 YHR218WYHR218W 1812 nt8.83□□□□□ -1
RRP36Q12481 EAF3YPR023C 1206 nt8.83□□□□□ -1
RRP36Q12481 LOT5YKL183W 921 nt8.82□□□□□ -1
RRP36Q12481 YDR306CYDR306C 1437 nt8.81□□□□□ -1
RRP36Q12481 CAB5YDR196C 726 nt8.81□□□□□ -1
RRP36Q12481 TIP1YBR067C 633 nt8.81□□□□□ -1
RRP36Q12481 YPI1YFR003C 468 nt8.8□□□□□ -1
RRP36Q12481 SAM3YPL274W 1764 nt8.8□□□□□ -1
RRP36Q12481 VRG4YGL225W 1014 nt8.79□□□□□ -1
RRP36Q12481 YJL118WYJL118W 660 nt8.79□□□□□ -1
RRP36Q12481 HXT10YFL011W 1641 nt8.79□□□□□ -1
RRP36Q12481 TPS1YBR126C 1488 nt8.78□□□□□ -1
RRP36Q12481 ITR2YOL103W 1830 nt8.78□□□□□ -1
RRP36Q12481 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.78□□□□□ -1
RRP36Q12481 YDR455CYDR455C 309 nt8.78□□□□□ -1
RRP36Q12481 VMA11YPL234C 495 nt8.78□□□□□ -1
RRP36Q12481 RIB7YBR153W 735 nt8.77□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 YLR173WYLR173W 1827 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 ERG13YML126C 1476 nt8.76□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 KRR1YCL059C 951 nt8.75□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 YJL055WYJL055W 738 nt8.75□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 YMR262WYMR262W 942 nt8.75□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 NSG2YNL156C 900 nt8.74□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 PUS7YOR243C 2031 nt8.74□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 DDI1YER143W 1287 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 SNX3YOR357C 489 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 HXT12YIL170W 1374 nt8.73□□□□□ -1.01
RRP36Q12481 TMA23YMR269W 636 nt8.7□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 RPC31YNL151C 756 nt8.7□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 INH1YDL181W 258 nt8.69□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 RRT8YOL048C 1029 nt8.68□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 RIM2YBR192W 1134 nt8.68□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 SAC7YDR389W 1965 nt8.68□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 AGP3YFL055W 1677 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 ADH1YOL086C 1047 nt8.67□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 IMO32YGR031W 1029 nt8.66□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 TOM71YHR117W 1920 nt8.66□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 GAL3YDR009W 1563 nt8.65□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 YNR029CYNR029C 1290 nt8.65□□□□□ -1.02
RRP36Q12481 RIB2YOL066C 1776 nt8.64□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 DPL1YDR294C 1770 nt8.63□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 YJL195CYJL195C 702 nt8.63□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 ELO1YJL196C 933 nt8.63□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 HXK1YFR053C 1458 nt8.63□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 RPN14YGL004C 1254 nt8.62□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 YJR114WYJR114W 393 nt8.62□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 YNR064CYNR064C 873 nt8.62□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 YOR072WYOR072W 315 nt8.62□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 YMR265CYMR265C 1386 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 ADE8YDR408C 645 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 PCP1YGR101W 1041 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 FUN14YAL008W 597 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 LEU4YNL104C 1860 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 ALD5YER073W 1563 nt8.61□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 NBA1YOL070C 1506 nt8.6□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 TPN1YGL186C 1740 nt8.6□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 KEL3YPL263C 1956 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 HAP5YOR358W 729 nt8.59□□□□□ -1.03
RRP36Q12481 SFL1YOR140W 2301 nt8.58□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 RTG2YGL252C 1767 nt8.56□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 YDR467CYDR467C 327 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 snR31snR31 225 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 SNU66YOR308C 1764 nt8.55□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 MTO1YGL236C 2010 nt8.54□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 SUV3YPL029W 2214 nt8.54□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 DAK2YFL053W 1776 nt8.53□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 YEL008WYEL008W 381 nt8.53□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 THI6YPL214C 1623 nt8.53□□□□□ -1.04
RRP36Q12481 DUR3YHL016C 2208 nt8.52□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 STE4YOR212W 1272 nt8.52□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 ALR1YOL130W 2580 nt8.52□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.51□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 OPI3YJR073C 621 nt8.51□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 NPP2YEL016C 1482 nt8.51□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 TVP23YDR084C 600 nt8.5□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 GCD11YER025W 1584 nt8.49□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 ADE2YOR128C 1716 nt8.49□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.47□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.47□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 CRC1YOR100C 984 nt8.47□□□□□ -1.05
RRP36Q12481 MEX67YPL169C 1800 nt8.46□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 SPS100YHR139C 981 nt8.46□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 IML3YBR107C 738 nt8.46□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 CCT5YJR064W 1689 nt8.46□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 MET1YKR069W 1782 nt8.45□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.44□□□□□ -1.06
RRP36Q12481 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.44□□□□□ -1.06
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