Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 NBA1YOL070C 1506 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 GPN2YOR262W 1044 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 SOL2YCR073W-A 948 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 COG1YGL223C 1254 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 VMA11YPL234C 495 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 MSB4YOL112W 1479 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 TAT2YOL020W 1779 nt7.77□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 KRR1YCL059C 951 nt7.77□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 SDH5YOL071W 489 nt7.76□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 TIP1YBR067C 633 nt7.76□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 MAS1YLR163C 1389 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 INH1YDL181W 258 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 YGR012WYGR012W 1182 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 RBG1YAL036C 1110 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 SRN2YLR119W 642 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 RPC31YNL151C 756 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 RSC4YKR008W 1878 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 ITR2YOL103W 1830 nt7.74□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 CSM1YCR086W 573 nt7.74□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 RIM2YBR192W 1134 nt7.74□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 LSB5YCL034W 1065 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM13Q12383 MCM5YLR274W 2328 nt7.71□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 PRY1YJL079C 900 nt7.71□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 SNX3YOR357C 489 nt7.71□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 YPL041CYPL041C 624 nt7.71□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 OYE2YHR179W 1203 nt7.69□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 BMT5YIL096C 1011 nt7.69□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 HMT1YBR034C 1047 nt7.68□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 EAF3YPR023C 1206 nt7.68□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 FTH1YBR207W 1398 nt7.68□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 MEX67YPL169C 1800 nt7.67□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 YHM2YMR241W 945 nt7.67□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.67□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.67□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 RPT5YOR117W 1305 nt7.67□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 DPL1YDR294C 1770 nt7.66□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 YDR455CYDR455C 309 nt7.66□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 LSM5YER146W 282 nt7.66□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 GND1YHR183W 1470 nt7.66□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 ERG13YML126C 1476 nt7.65□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 LEU4YNL104C 1860 nt7.65□□□□□ -1.18
TRM13Q12383 MIM1YOL026C 342 nt7.64□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 SAM3YPL274W 1764 nt7.64□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.63□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 FRA1YLL029W 2250 nt7.62□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 YDR467CYDR467C 327 nt7.61□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 RAD23YEL037C 1197 nt7.61□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 SMM1YNR015W 1155 nt7.61□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 SAC7YDR389W 1965 nt7.6□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 TPS1YBR126C 1488 nt7.6□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 YMR265CYMR265C 1386 nt7.59□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 DDI1YER143W 1287 nt7.59□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 NPP2YEL016C 1482 nt7.59□□□□□ -1.19
TRM13Q12383 RPN14YGL004C 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 FET5YFL041W 1869 nt7.58□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 HBS1YKR084C 1836 nt7.57□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.57□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.57□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 NSG2YNL156C 900 nt7.57□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 HAP5YOR358W 729 nt7.57□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 YTH1YPR107C 627 nt7.57□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 ELO1YJL196C 933 nt7.56□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 YNR064CYNR064C 873 nt7.56□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 RRT8YOL048C 1029 nt7.56□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 YDR306CYDR306C 1437 nt7.55□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 TMA23YMR269W 636 nt7.55□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 RIB7YBR153W 735 nt7.55□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 PUS7YOR243C 2031 nt7.55□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 YIL177CYIL177C 5277 nt7.54□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 MDL2YPL270W 2322 nt7.54□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 FAF1YIL019W 1041 nt7.54□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 LOT5YKL183W 921 nt7.54□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 TOM71YHR117W 1920 nt7.52□□□□□ -1.2
TRM13Q12383 RIB3YDR487C 627 nt7.52□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.51□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 VRG4YGL225W 1014 nt7.51□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 IMO32YGR031W 1029 nt7.51□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 YJL055WYJL055W 738 nt7.51□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 ORT1YOR130C 879 nt7.51□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 KEL3YPL263C 1956 nt7.51□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 TPN1YGL186C 1740 nt7.5□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 ADE8YDR408C 645 nt7.5□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 YJR114WYJR114W 393 nt7.5□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 YLR111WYLR111W 333 nt7.5□□□□□ -1.21
TRM13Q12383 YBL095WYBL095W 813 nt7.5□□□□□ -1.21
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