Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 TIP1YBR067C 633 nt9.29□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 INH1YDL181W 258 nt9.28□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 PRY1YJL079C 900 nt9.28□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 LSB5YCL034W 1065 nt9.27□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 DPL1YDR294C 1770 nt9.27□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 YDR455CYDR455C 309 nt9.26□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 SNX3YOR357C 489 nt9.26□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 EAF3YPR023C 1206 nt9.26□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 SAM3YPL274W 1764 nt9.24□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 OYE2YHR179W 1203 nt9.24□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.24□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 RPT5YOR117W 1305 nt9.23□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 MEX67YPL169C 1800 nt9.21□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 LEU4YNL104C 1860 nt9.21□□□□□ -0.93
RUD3Q12234 GND1YHR183W 1470 nt9.21□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 ERG13YML126C 1476 nt9.21□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 RIB3YDR487C 627 nt9.2□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 SAC7YDR389W 1965 nt9.2□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 LSM5YER146W 282 nt9.19□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 RBG2YGR173W 1107 nt9.19□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 SMM1YNR015W 1155 nt9.18□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 YJL118WYJL118W 660 nt9.16□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 TPS1YBR126C 1488 nt9.15□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 FET5YFL041W 1869 nt9.15□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 MIM1YOL026C 342 nt9.15□□□□□ -0.94
RUD3Q12234 YMR265CYMR265C 1386 nt9.13□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 DDI1YER143W 1287 nt9.13□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.13□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 RRT8YOL048C 1029 nt9.13□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 NPP2YEL016C 1482 nt9.13□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 CAB5YDR196C 726 nt9.12□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 NSG2YNL156C 900 nt9.12□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 HBS1YKR084C 1836 nt9.12□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.11□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.11□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 YDR467CYDR467C 327 nt9.11□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 LOT5YKL183W 921 nt9.11□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 TMA23YMR269W 636 nt9.1□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 MDL2YPL270W 2322 nt9.1□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 RPN14YGL004C 1254 nt9.09□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 HAP5YOR358W 729 nt9.09□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 TOM71YHR117W 1920 nt9.09□□□□□ -0.95
RUD3Q12234 ELO1YJL196C 933 nt9.08□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YNR064CYNR064C 873 nt9.08□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YIL177CYIL177C 5277 nt9.07□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 RIB7YBR153W 735 nt9.07□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YLR173WYLR173W 1827 nt9.07□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 IMO32YGR031W 1029 nt9.06□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 SUV3YPL029W 2214 nt9.06□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 TPN1YGL186C 1740 nt9.05□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 HXT12YIL170W 1374 nt9.05□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YRF1-3YGR296W 5580 nt9.05□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YRF1-6YNL339C 5580 nt9.05□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YRF1-7YPL283C 5580 nt9.05□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 MAS1YLR163C 1389 nt9.04□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 YJL055WYJL055W 738 nt9.04□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 KEL3YPL263C 1956 nt9.04□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 VRG4YGL225W 1014 nt9.03□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 MTO1YGL236C 2010 nt9.03□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 DUR3YHL016C 2208 nt9.03□□□□□ -0.96
RUD3Q12234 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.02□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 DAK2YFL053W 1776 nt9.02□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 YJR114WYJR114W 393 nt9.02□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 TRP2YER090W 1524 nt9.01□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 GAL3YDR009W 1563 nt9.01□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 HXT11YOL156W 1704 nt9□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 ADE8YDR408C 645 nt9□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 YBL095WYBL095W 813 nt9□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 ORT1YOR130C 879 nt9□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 THI6YPL214C 1623 nt9□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 YPI1YFR003C 468 nt8.99□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 GPM1YKL152C 744 nt8.98□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 snR31snR31 225 nt8.98□□□□□ -0.97
RUD3Q12234 GNP1YDR508C 1992 nt8.96□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 OPI3YJR073C 621 nt8.95□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 CRC1YOR100C 984 nt8.95□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 SFL1YOR140W 2301 nt8.95□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 EMC3YKL207W 762 nt8.94□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 FIT1YDR534C 1587 nt8.94□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 AAT1YKL106W 1356 nt8.93□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 RTG2YGL252C 1767 nt8.93□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 UFD1YGR048W 1086 nt8.92□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.91□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 YMC2YBR104W 990 nt8.91□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 SRM1YGL097W 1449 nt8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms