Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd12Q0VE29 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samd12Q0VE29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd12Q0VE29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd12Q0VE29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms