Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Vps8Q0P5W1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Vps8Q0P5W1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36,68■■■■□ 3,46
Vps8Q0P5W1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Vps8Q0P5W1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Vps8Q0P5W1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36,66■■■■□ 3,46
Vps8Q0P5W1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,45
Vps8Q0P5W1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Vps8Q0P5W1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Vps8Q0P5W1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Vps8Q0P5W1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Vps8Q0P5W1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Vps8Q0P5W1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Vps8Q0P5W1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Vps8Q0P5W1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,4
Vps8Q0P5W1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36,21■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36,2■■■■□ 3,39
Vps8Q0P5W1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,38
Vps8Q0P5W1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Vps8Q0P5W1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Vps8Q0P5W1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Vps8Q0P5W1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Vps8Q0P5W1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms