Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf3Q07104 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf3Q07104 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gdf3Q07104 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf3Q07104 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms