Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col10a1Q05306 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col10a1Q05306 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col10a1Q05306 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col10a1Q05306 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col10a1Q05306 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col10a1Q05306 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col10a1Q05306 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col10a1Q05306 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col10a1Q05306 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col10a1Q05306 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col10a1Q05306 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col10a1Q05306 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms