Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms