Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Serpina1cQ00896 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Serpina1cQ00896 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Serpina1cQ00896 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1cQ00896 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Serpina1cQ00896 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1cQ00896 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Serpina1cQ00896 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Serpina1cQ00896 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms