Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SeleQ00690 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SeleQ00690 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SeleQ00690 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SeleQ00690 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SeleQ00690 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SeleQ00690 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SeleQ00690 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SeleQ00690 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SeleQ00690 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SeleQ00690 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SeleQ00690 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SeleQ00690 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeleQ00690 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SeleQ00690 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SeleQ00690 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms