Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rbbp6P97868 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rbbp6P97868 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rbbp6P97868 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rbbp6P97868 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rbbp6P97868 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rbbp6P97868 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Rbbp6P97868 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms