Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Taf1bP97358 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf1bP97358 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf1bP97358 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf1bP97358 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Taf1bP97358 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf1bP97358 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf1bP97358 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms