Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx1P83917 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx1P83917 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx1P83917 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cbx1P83917 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cbx1P83917 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx1P83917 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms