Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nucb2P81117 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb2P81117 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nucb2P81117 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nucb2P81117 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nucb2P81117 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nucb2P81117 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nucb2P81117 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms