Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrig1P70193 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lrig1P70193 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrig1P70193 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig1P70193 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig1P70193 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms