Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cntn5P68500 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn5P68500 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntn5P68500 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntn5P68500 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn5P68500 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn5P68500 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntn5P68500 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn5P68500 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms