Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uchl4P58321 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uchl4P58321 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uchl4P58321 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Uchl4P58321 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uchl4P58321 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uchl4P58321 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms