Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acod1P54987 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acod1P54987 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acod1P54987 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acod1P54987 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acod1P54987 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acod1P54987 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acod1P54987 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acod1P54987 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acod1P54987 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acod1P54987 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acod1P54987 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acod1P54987 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Acod1P54987 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acod1P54987 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acod1P54987 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acod1P54987 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acod1P54987 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms