Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgf9P54130 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgf9P54130 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgf9P54130 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fgf9P54130 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf9P54130 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf9P54130 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgf9P54130 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgf9P54130 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf9P54130 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf9P54130 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf9P54130 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf9P54130 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf9P54130 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgf9P54130 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgf9P54130 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf9P54130 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgf9P54130 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf9P54130 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf9P54130 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf9P54130 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgf9P54130 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf9P54130 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf9P54130 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf9P54130 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf9P54130 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf9P54130 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgf9P54130 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf9P54130 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgf9P54130 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf9P54130 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf9P54130 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf9P54130 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms