Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 BUR6YER159C 429 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 ENT4YLL038C 744 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 RPC31YNL151C 756 nt8.21□□□□□ -1.1
RAI1P53063 RPS14BYJL191W 417 nt8.2□□□□□ -1.1
RAI1P53063 PUS5YLR165C 765 nt8.2□□□□□ -1.1
RAI1P53063 MIM1YOL026C 342 nt8.19□□□□□ -1.1
RAI1P53063 LEU4YNL104C 1860 nt8.18□□□□□ -1.1
RAI1P53063 BNS1YGR230W 414 nt8.18□□□□□ -1.1
RAI1P53063 YHM2YMR241W 945 nt8.18□□□□□ -1.1
RAI1P53063 VMA11YPL234C 495 nt8.18□□□□□ -1.1
RAI1P53063 YCR087WYCR087W 516 nt8.17□□□□□ -1.1
RAI1P53063 SOL2YCR073W-A 948 nt8.16□□□□□ -1.1
RAI1P53063 DAK2YFL053W 1776 nt8.16□□□□□ -1.1
RAI1P53063 TOM71YHR117W 1920 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 HBS1YKR084C 1836 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 TPN1YGL186C 1740 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 INH1YDL181W 258 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 YDR455CYDR455C 309 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 XYL2YLR070C 1071 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 REC114YMR133W 1287 nt8.15□□□□□ -1.1
RAI1P53063 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.14□□□□□ -1.11
RAI1P53063 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.14□□□□□ -1.11
RAI1P53063 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.14□□□□□ -1.11
RAI1P53063 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.14□□□□□ -1.11
RAI1P53063 GPN2YOR262W 1044 nt8.14□□□□□ -1.11
RAI1P53063 TIP1YBR067C 633 nt8.14□□□□□ -1.11
RAI1P53063 FHN1YGR131W 525 nt8.13□□□□□ -1.11
RAI1P53063 ADO1YJR105W 1023 nt8.13□□□□□ -1.11
RAI1P53063 SNX3YOR357C 489 nt8.13□□□□□ -1.11
RAI1P53063 NPP2YEL016C 1482 nt8.13□□□□□ -1.11
RAI1P53063 KRR1YCL059C 951 nt8.12□□□□□ -1.11
RAI1P53063 LSM5YER146W 282 nt8.12□□□□□ -1.11
RAI1P53063 DUR3YHL016C 2208 nt8.12□□□□□ -1.11
RAI1P53063 THI74YDR438W 1113 nt8.11□□□□□ -1.11
RAI1P53063 KDX1YKL161C 1302 nt8.1□□□□□ -1.11
RAI1P53063 CSM1YCR086W 573 nt8.1□□□□□ -1.11
RAI1P53063 RAS2YNL098C 969 nt8.1□□□□□ -1.11
RAI1P53063 NSG2YNL156C 900 nt8.1□□□□□ -1.11
RAI1P53063 AIM45YPR004C 1035 nt8.1□□□□□ -1.11
RAI1P53063 UFD1YGR048W 1086 nt8.09□□□□□ -1.11
RAI1P53063 YLR279WYLR279W 390 nt8.09□□□□□ -1.11
RAI1P53063 ATG17YLR423C 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
RAI1P53063 YDR306CYDR306C 1437 nt8.09□□□□□ -1.11
RAI1P53063 FIT1YDR534C 1587 nt8.09□□□□□ -1.11
RAI1P53063 APT2YDR441C 546 nt8.08□□□□□ -1.12
RAI1P53063 SRN2YLR119W 642 nt8.08□□□□□ -1.12
RAI1P53063 FCY21YER060W 1587 nt8.08□□□□□ -1.12
RAI1P53063 SAC7YDR389W 1965 nt8.07□□□□□ -1.12
RAI1P53063 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.06□□□□□ -1.12
RAI1P53063 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.06□□□□□ -1.12
RAI1P53063 MSB4YOL112W 1479 nt8.06□□□□□ -1.12
RAI1P53063 SFL1YOR140W 2301 nt8.06□□□□□ -1.12
RAI1P53063 DUS3YLR401C 2007 nt8.05□□□□□ -1.12
RAI1P53063 MCM5YLR274W 2328 nt8.05□□□□□ -1.12
RAI1P53063 NAT4YMR069W 858 nt8.05□□□□□ -1.12
RAI1P53063 TRP2YER090W 1524 nt8.04□□□□□ -1.12
RAI1P53063 RRT5YFR032C 870 nt8.04□□□□□ -1.12
RAI1P53063 ALR1YOL130W 2580 nt8.04□□□□□ -1.12
RAI1P53063 PUS7YOR243C 2031 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 SAM3YPL274W 1764 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 ERG13YML126C 1476 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 HMT1YBR034C 1047 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 EAF3YPR023C 1206 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 YLR173WYLR173W 1827 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 HXT11YOL156W 1704 nt8.03□□□□□ -1.12
RAI1P53063 NUC1YJL208C 990 nt8.02□□□□□ -1.13
RAI1P53063 TSC10YBR265W 963 nt8.02□□□□□ -1.13
RAI1P53063 LSB5YCL034W 1065 nt8.02□□□□□ -1.13
RAI1P53063 YDR467CYDR467C 327 nt8.01□□□□□ -1.13
RAI1P53063 YGL034CYGL034C 366 nt8.01□□□□□ -1.13
RAI1P53063 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt8.01□□□□□ -1.13
RAI1P53063 ORT1YOR130C 879 nt8.01□□□□□ -1.13
RAI1P53063 GND1YHR183W 1470 nt8□□□□□ -1.13
RAI1P53063 THI6YPL214C 1623 nt8□□□□□ -1.13
RAI1P53063 LOT5YKL183W 921 nt8□□□□□ -1.13
RAI1P53063 YMR265CYMR265C 1386 nt7.98□□□□□ -1.13
RAI1P53063 SRM1YGL097W 1449 nt7.98□□□□□ -1.13
RAI1P53063 RBG1YAL036C 1110 nt7.98□□□□□ -1.13
RAI1P53063 OYE2YHR179W 1203 nt7.97□□□□□ -1.13
RAI1P53063 ELO1YJL196C 933 nt7.97□□□□□ -1.13
RAI1P53063 snR4snR4 186 nt7.97□□□□□ -1.13
RAI1P53063 LPD1YFL018C 1500 nt7.97□□□□□ -1.13
RAI1P53063 POP2YNR052C 1302 nt7.97□□□□□ -1.13
RAI1P53063 PRY1YJL079C 900 nt7.96□□□□□ -1.14
RAI1P53063 RTG2YGL252C 1767 nt7.95□□□□□ -1.14
RAI1P53063 BMT5YIL096C 1011 nt7.95□□□□□ -1.14
RAI1P53063 SUV3YPL029W 2214 nt7.95□□□□□ -1.14
RAI1P53063 DDI1YER143W 1287 nt7.94□□□□□ -1.14
RAI1P53063 YGR012WYGR012W 1182 nt7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms